宇宙航空研究開発機構（JAXA)や北海道大などのチームが、６月９日付の米科学誌サイエンス電子版に、「はやぶさ２」が持ち帰った小惑星リュウグウの試料に、多量の水が含まれていたとする分析結果を発表した。地球の水は太古に小天体が衝突してもたらされたという説があり、海の起源の謎を解明する鍵になる可能性がある。
チームは採取された砂や石の化学組成を精密に測定。主な成分は水を含む粘土鉱物で、ほかに炭酸塩鉱物や硫化鉄なども含んでいた。水は質量比で全体の約７％を占めた。液体の水ではなく、ほとんどが酸素と水素の原子が結合した水酸基（OH）の状態で存在していたが、水分子（H2O）も確認された。
リュウグウは約46億年前の太陽系の誕生から間もないころにできた小天体が壊れてできたと考えられている。小天体に約40度の水があったとすると、これらの鉱物ができた理由がうまく説明できるという。

中国由来の木造手漕ぎ舟「ペーロン」の速さを競う「相生ペーロン祭」が５月29日、兵庫県相生市で2019年以来３年ぶりに開催された。今年はペーロンが長崎県から相生市に伝えられて100周年を記念する大会となった。
兵庫県内外から企業や自治体、高校生ら39チーム が参加。それぞれ全長約13ｍ、32人乗りの舟、ペーロンに乗り込んで銅鑼（どら）や太鼓の音を響かせ、勇ましい掛け声を上げながら、レースを楽しんだ。2020年、2021年は新型コロナウイルス禍で中止された。

理化学研究所などの研究チームは５月26日、約４億年前の地層から見つかった謎の生き物「パレオスポンディルス」の化石を詳しく調べ、正体を突き止めたと発表した。魚類と両生類の中間にあたる特徴が見つかり、陸に上がる前の脊椎（せきつい）動物と考えられるという。この研究成果を25日付の科学誌ネイチャー電子版に発表した。
パレオスポンディルスは「古代の背骨」という意味。化石は19世紀、スコットランドの約３億9,000万年前（デボン紀）に湖だった場所から見つかった。骨の特徴をほかの脊椎動物と比較し、進化の過程をに位置付けたところ、肺魚と陸上脊椎動物のの中間にあたる生き物と推定された。魚と両生類をつなぐ「ミッシングリンク」（失われた輪＝進化の過程で存在したはずだが、化石が見つかっていない生物）の一つだと考えられるという。

東日本大震災からの復興を願い、東北６県を代表する夏祭りが集結する第５回「東北絆まつり」が５月28日、秋田市で開幕した。29日まで。航空自衛隊のアクロバット飛行チーム「ブルーインパルス」が秋田市上空を飛行し、大勢の来場者で賑わった。
夜には新型コロナウイルスの影響で過去２年、中止していたパレードも３年ぶりに復活した。パレードは午後６時すぎに地元・秋田の竿燈（かんとう）まつりでスタート。次いで、盛岡のさんさ踊りなど６つの祭りの出演者らが会場の陸上競技場を練り歩いた。メイン会場では秋田の郷土芸能が披露された。
東北絆まつりは2016年まで開かれた「東北６魂祭」の後継行事として、2017年から６県が持ち回りで開催。

山梨大学の研究チームは５月10日までに、化石のＤＮＡ解析に基づき、二ホンオオカミのルーツに迫る新説をまとめた。
その結果、日本に多く生息したが、20世紀初めに絶滅した二ホンオオカミは大昔に来た巨大オオカミと、３万7,000～１万4,000年前ごろにユーラシア大陸から入ったオオカミが交雑して日本列島で生まれたというもの。
栃木県佐野市で見つかった３万5,000年前の巨大オオカミと、5,000年前の二ホンオオカミの化石からＤＮＡを抽出し、遺伝子を解析した。この２つには遺伝的な関係があり、さらに現在の大陸に生息する系統ともつながることが確かめられた。

奈良、大阪、京都を結ぶ近鉄の新たな観光特急「あおによし」の運行が４月29日から始まり、記念セレモニーが近鉄奈良駅で行われた。雅楽が演奏され、天平時代の衣装に身を包んだ人たちなどが出迎える中、大阪難波駅を出発した第１便が午前10時すぎに到着した。
奈良の枕ことばにちなんで名付けられた「あおによし」は2021年２月に引退した特急の車両を改造したもので、４両編成の列車にゆったりと寛（くつ）げるように84の座席が配置されている。車内の壁や天井などに、天平文様があしらわれるなど、奈良を感じさせるデザインが特徴。
「あおによし」は奈良、大阪、京都の間で１日６便運行されるが、近鉄によると５月５日まで全列車の座席が予約で満席だという。

京都市左京区の「京都市京セラ美術館」で、およそ2,000年前の火山の大噴火で埋もれた、イタリア南部・ナポリ近郊の古代都市の遺跡、ポンペイの美術品などを紹介する展示会が開かれている。
同展にはナポリ国立考古学博物館に所蔵されている遺跡の出土品などおよそ120点が展示される。このうち「踊るファウヌス」は、高さおよそ70ｃｍの彫刻で体を強くねじる構図に当時の美術の特徴が表れている。また、直径20ｃｍほどの「炭化したパン」は、ポンペイの街から見つかったとされていて、当時の生活を感じさせる。このほか、モザイク画の世界的な傑作とされる「アレクサンドロス大王のモザイク」をレプリカや映像で見ることができる。

京都の「祇園祭山鉾連合会」は４月20日、祇園祭の山鉾巡行を新型コロナの感染拡大を防ぐため、開催時間を短縮し、参加者が密にならない対策などを講じたうえで、３年ぶりに実施すると発表した。山鉾巡行は新型コロナの影響で2020年、2021年と中止されており、実施は３年ぶりとなる。
京都の祇園祭は1000年以上の歴史がある祭りで、山鉾巡行は祭りのハイライトとして知られている。連合会によると、例年通り「前祭」は７月17日、「後祭」は７月24日に実施される。

大阪・造幣局（所在地：大阪市北区）の「桜の通り抜け」が、感染防止対策を取ったうえで、４月13～19日の７日間の日程で開催されることになった。
130年以上前から続く春の恒例行事で、およそ560ｍの並木道に植えられた340本ほどの桜を見に毎年60万人余りが訪れる。新型コロナ禍で2020年、2021年と続けて中止された。
参加の受付はインターネットによる事前申込制で、30分あたりの入場者数の上限を1,200人に制限し、期間中の入場者数を例年の30％にあたる17万人余りに抑えるとしている。

京都の春を彩る、祇園の芸妓・舞妓による舞踊公演「都をどり」が３年ぶりに開催されることになった。主催団体は芸・舞妓の育成や伝統を継承させる必要があるとして、感染対策を取ったうえで実施する。ただ、感染防止のため出演する芸・舞妓を例年より少なくするほか、新型コロナ収束を願う演目も取り入れる。
都をどりは、京都の花街の１つ、祇園甲部の芸・舞妓らによる舞踊公演で、140年余りの歴史がある。例年使用の会場が工事中のため、近くの「南座」を会場にして、４月１日から24日まで開催される。