菅首相の任期満了の９月末での退陣意向表明を受け、自民党総裁選の動きが急に慌しくなってきた。石破茂元幹事長は９月３日、これまで出馬に慎重な考えを示してきたが一転、出馬を検討する考えを示した。河野太郎規制改革担当相も出馬を検討する見通しだ。河野氏もこれまで自身の出馬について、「まずワクチン接種、いまの仕事をしっかりやりたい」として慎重だった。このほか、高市早苗前総務相も出馬に意欲をみせている。総裁選にはすでに岸田文雄前政調会長が出馬表明している。

東京パラリンピック第11日の９月３日、自転車の女子個人ロードレース（運動機能障害Ｃ１～３）で50歳の杉浦佳子が個人ロードタイムトライアルに続いて金メダルを獲得した。45歳の時、自転車レースで転倒し、右半身のマヒや記憶障害を負った。リハビリを兼ねて続けた自転車競技で頭角を現し、2018年世界選手権のタイムトライアルで優勝している。

東京パラリンピック第10の９月２日、競泳男子50ｍ自由形（運動機能障害Ｓ４）の鈴木孝幸が銀メダルを獲得した。今大会出場全５種目でメダルを取り、通算10個目。
女子50ｍ背泳ぎ（運動機能障害Ｓ２）の山田美幸も２位を確保。日本の史上最年少メダリストとなった100ｍに続いて２つ目の銀メダルを獲得した。

世界保健機関（ＷＨＯ）の試算によると、世界全体の認知症患者は2019年時点で5,520万人に上っている。今後も増え続け、2030年に7,800万人、そして2050年には１億3,900万人と、2019年の約2.5倍に達すると予測している。
高齢社会の進行で避けられないことだが、幅広い世代が不公平感なく過ごすには、公的介護制度はじめ社会全体で患者や家族を支える、充実した仕組みづくりが不可欠だ。超高齢社会を迎えている日本だけに、いつまでも課題の先送りは許されない。

世界気象機関は９月１日、1970年から2019年までの過去50年間の世界の異常気象による被害についてレポートを公表した。これによると、干ばつや洪水など10年ごとの災害件数は５倍になり、50年間で１万1,000件を超えた。また、気象警報システムの進化などによって、死者は減少しているものの、合わせて200万人以上が死亡し、３兆6,000億ドルの経済損失が発生したという。
今後について、「気候変動によって世界の多くの地域で異常気象はさらに多く、深刻になる」と警告している。

９月３日開かれた自民党の臨時役員会で、前日まで再選に向け出馬に意欲を示していた菅首相が急転、「新型コロナウイルス対策に専念したい」とし、「総裁選に出馬しない」旨、表明した。これに伴い、菅氏は任期切れとなる９月末で首相を退陣することになる。
病気に倒れた安倍首相の後を受け、７割近い支持率でスタートした菅内閣だったが、後手後手のコロナ対応の印象を拭えず、コロナ感染拡大防止とは完全に矛盾し、世論に逆らったオリンピック強行で遂に失点を挽回できないまま、１年で幕を下ろす。
自民党総裁選は９月17日告示、同29日投開票の予定で、内閣支持率の低迷下にあっても、菅氏は官邸はもとより党執行部にも続投の強い意思を明確に伝え、再選に意欲を見せていた。わずか１日の間に果たして「総裁選出馬」から「不出馬」を決断させる決定的な出来事があったのか？闇の中だ。

東京パラリンピック第９日の９月１日、車いすテニスの混合上下肢障害ダブルスで、諸石光照（54）、菅野浩二（40）のペアが銅メダルを獲得した。上半身にも障害がある選手によるこの種目が2004年アテネ大会で実施されて以来、日本勢初のメダル。
午後９時前に始まった３位決定戦の試合は、雨のため中断。屋根のあるセンターコートに移って深夜に再開された。同ペアはフルセットにもつれ込む接戦となったが、７－５、３－６、７－５で英国ペアを退け、翌日早朝にまで及んだ熱闘を制した。

厚生労働省の調べによると、６月下旬と７月上旬に成田・羽田の空港検疫所で陽性と確認された40代と50代の女性２人が変異ウイルスの「ミュー株」に感染していたことが分かった。国内でミュー株が確認されたのは初めて。
ミュー株は南米や欧州で報告され、世界保健機関（ＷＨＯ）は８月30日、ワクチンの効果や感染力に影響を与える可能性などがある「ＶＯＩ（＝注目すべき変異株）」に位置付けている。今年１月にコロンビアで初めて確認されて以降、30カ国以上で感染が確認されている。

日本国内で確認された新型コロナウイルスの感染者が、累計で150万人を超えた。驚くのがデルタ株の広がりによる感染スピードの速さ。国内の累計感染者数が50万人から100万人を超えるまでにかかった日数がおよそ４カ月だったが、今回100万人から150万人を超えるまでに要した日数はわずか26日だった。連日、新規感染者数が過去最多を更新し続けたことで分かるように、急速に感染者が増えた様子が数字に表れている。