日本産科婦人科学会のまとめによると、2019年に国内で実施された体外受精により生まれた子どもは６万598人で、前年に続いて過去最多を更新したことが分かった。生まれてきた子の14人に１人が体外受精で誕生したことになる。1983年に国内初の体外受精児が誕生して以来、累計で71万931人に上り、70万人を突破した。

大阪府は宿泊療養施設の一部に医師や看護師が常駐する診療スペースを整備する方針を決め、９月21日から運営する医療機関を公募することになった。次のコロナ感染の第６波で、感染力の強い変異株に見舞われた場合、病床のひっ迫を抑えるには、ホテルなどでの宿泊療養者の重症化を防ぐ手立てが必要と判断、整備を決めたもの。
具体的には診察室や点滴室などを設けて、日中は医師や看護師を常駐させ、軽症患者などに使用できる「抗体カクテル療法」や解熱剤の処方などを行う。すべての宿泊療養施設でこうした体制を整えるのは難しいことから、まずは数カ所の施設で整備を進める方針。
大阪府は、軽症や無症状で入院の必要のない感染者を31の宿泊療養施設で受け入れていて、感染の第５波で宿泊療養者は一時、3,500人以上に上った。

自民党の野田聖子幹事長代行は９月16日、必要な推薦人20人が集まったとして総裁選への出馬を正式に表明した。野田氏は「これまで主役になれなかった女性、子ども、高齢者、障がい者がしっかりとこの社会の中で生きていける、そして生きる価値があるんだという、そういう保守の政治を自民党の中でつくり上げていきたい」と語った。
この結果、17日に告示される自民党総裁選挙は岸田文雄元政調会長、高市早苗元総務相、河野太郎規制改革相の３氏を合わせた４人で争われることになった。

菅首相は９月15日、新形コロナウイルスに感染した際の重症化を防ぐ中和抗体薬について、在宅医療（往診）での使用を認めるよう、厚生労働省に検討を指示したことを明らかにした。軽症・中等症患者を対象とした中和抗体薬は、点滴投与することから、現在は入院や通院、臨時医療施設での使用に限定されている。

厚生労働省は９月14日、100歳以上の高齢者が過去最多の８万6,510人になったと発表した。１年前に比べて6,060人増えた。男性は初の１万人を超えた。ただ、女性は男性の７倍以上に上り、全体の９割に迫った。最高齢は女性が118歳、男性は111歳だった。100歳以上の高齢者は、医療技術の進歩などを背景に1971年から51年連続で増え続けている。

将棋の第６期叡王戦五番勝負の第５局は９月13日、東京都渋谷区の将棋会館で指され、藤井聡太二冠（19）が豊島将之叡王（31、竜王）を破り、対戦成績３勝２敗でタイトルを奪取した。19歳１カ月の藤井新叡王は王位・棋聖と合わせた三冠となり、羽生善治九段（50）が1993年に達成した22歳３カ月の最年少記録を28年ぶりに更新した。
将棋界では過去に９人が三冠を達成しており、藤井三冠は10人目で最年少、10代で初の達成。現在のタイトル保持数では渡辺明三冠（37、名人・棋王・王将）と並んで最多タイ。

米国のバイデン大統領は９月９日、新型コロナウイルス対策として従業員が100人以上の企業に対して、ワクチンの接種か少なくとも週１回の検査を義務付ける方針を示し、一段と厳しい対応に乗り出した。対象となるのはおよそ8,000万人に上り、従わない場合は１件の違反当たり最高で１万4,000ドル（日本円で150万円余）の罰金を科すという。
米国ではデルタ株の感染拡大が続いており、ＣＤＣ（疾病対策センター）によると、１日に亡くなった人の数は９月８日に1,600人を超えている。
こうした対応に対して共和党から「憲法違反で権威主義的だ」などの批判があるが、バイデン大統領は「ワクチン接種は個人の選択の自由の問題ではない。自分や自分の周りの人を守るためのものだ」と理解を求めている。

政府は９月13日、新型コロナウイルスのワクチン接種を２回終えた人が国民の５割を超えたと発表した。２回の接種を終えたのは国民の50.9％に相当する約6,447万人で、このうち約622万人が職場や大学での職域接種だった。
米欧に比べ大幅に出遅れていた日本の新型コロナウイルスのワクチン接種。政府によると、米国で接種を完了した人の割合は、９月１日現在で51.7％で、現状のペースなら９月末には６割を超え、近く米国を上回る見通し。
ワクチン頼みのコロナ対策と揶揄されたが、政府の自治体や医療関係者への早期実施を促す諸施策も加わって、着実にペースが上がり、欧米と肩を並べる水準まできた。政府は10月から11月の早い時期に希望者全員の接種を終える目標を掲げている。
政府は新規感染者が前週を下回る地域が増えていることから、９月末まで延長した緊急事態宣言の解除を見据えつつ、コロナ対策の行動制限を緩める方針。従来の対応の遅れへの反省から３回目の接種などに備えた2022年以降のワクチン確保にも動き始めている。

テニスの４大大会、全米オープン、車いすの部 男子シングルス決勝で９月12日（日本時間13日）、国枝慎吾が２年連続８度目の優勝を飾った。英国のアルフィー・ヒューイットを６－１、６－４のストレートで下した。
車いすの部 女子シングルス決勝は、東京パラリンピックの決勝戦と同様、上地結衣と”天敵”オランダのディーデ・デフロートとの対戦となった。上地は東京パラリンピックのリベンジを目指したが、鉄壁の牙城を崩せず、３－６、２－６で敗れ、悔しい準優勝に終わった。

岸信夫防衛相は９月12日、訪問先のベトナムで、同国との防衛協力を新たな段階へと進化させるとし、11日に署名した防衛装備品・技術移転協定をもとに、装備品の輸出について協議を加速すると言明した。東・南シナ海で軍事的圧力を強める中国をにらんだ安全保障協力の一環。